С 1956 по 1975 гг. кафедру офтальмологии возглавлял заслуженный деятель науки РСФСР и БАССР профессор Г. Х. Кудояров. Крупнейший трахоматолог, прекрасный клиницист, педагог, активно, до последних лет своей жизни, работал на кафедре.

Научные исследования, организационные и профилактические мероприятия, проведённые профессором Г. Х. Кудояровым, легли в основу борьбы и ликвидации трахомы не только в Башкирии, но и других республиках и областях СССР и за рубежом. Большое внимание уделял Г. Х. Кудояров изучению различных аспектов вирусных и грибковых заболеваний органа зрения, конъюнктивитам различной этиологии. Активный хирург, он успешно разрабатывал вопросы хирургического лечения при глаукоме, катаракте, бельмах роговицы, при герпетическом кератите.

Профессор Г. Х. Кудояров — автор более 160 научных работ, им написано четыре монографии: «Учебник по глазным болезням для средних медицинских работников», «Биомикроскопические изменения на роговой оболочке при трахоме», «Руководство по трахоме», «Возникновение и течение трахомы». Под руководством Г. Х. Кудоярова защи-щены 3 докторских, 21 кандидатская диссертация. Профессор Н. А. Завьялова, профессор Р. Г. Кудояров, профессор М. Т. Азнабаев, к.м.н. С. И. Сюняева, к.м.н. Р. З. Вафина, к.м.н. Р. С. Закиров, к.м.н. Ф. З. Нугаева, к.м.н. М. К. Каримов, к.м.н. Е. Н. Семенова и многие научные сотрудники Уфимского НИИ глазных болезней выполняли научные исследования под руководством Г. Х. Кудоярова по самым различным направления офтальмологии.

С 1987 года и по 2011 год кафедру офтальмологии возглавлял заслуженный деятель науки РФ и РБ, заслуженный врач РСФСР и БАССР, Лауреат Государственной премии РБ в области науки и техники, доктор медицинских наук, профессор, академик АН РБ М. Т. Азнабаев.

Марат Талгатович — ученик и последователь профессора Г. Х. Кудоярова, окончил на кафедре ординатуру и аспирантуру, был ассистентом и доцентом кафедры. Профессор М. Т. Азнабаев являлся директором Уфимского НИИ глазных болезней (1980−2006 гг.).

В 1987 году М. Т. Азнабаевым защищена докторская диссертация на тему «Новые методы и эффективность микрохирургии катаракт у детей», разработаны современные способы и инструменты хирургии врожденной патологии хрусталика, впервые обосновано раннее (у детей 2−3-х недельного возраста) хирургическое вмешательство при врожденной катаракте. Достигнуты высокие функциональные результаты при оперативном лечении и последующей коррекции данной патологии у детей раннего возраста (период новорожденности). Создано новое направление в детской офтальмохирургии, разработан ряд новых инструментов и оборудования для микроопераций глаза.

В 1995 году избран действительным членом, АН Республики Башкортостан. Профессор М. Т. Азнабаев — заслуженный деятель науки РБ и РФ, заслуженный врач РБ и РФ, награжден орденами «Почета России», «Салавата Юлаева», «Чести и Славы». Является автором свыше 600 научных работ, 17 книг, более 130 изобретений, 145 методических рекомендаций. Под его руководством защищены 7 докторских и 44 кандидатских диссертации. Им создана Уфимская научная школа детских офтальмологов. Под редакцией академика АН РБ М. Т. Азнабаева вышли Русско-башкирский толковый словарь медицинских терминов в 2007 году (840 страниц) и русско-башкирский словарь офтальмологических терминов в 2004 году (111 страниц). М. Т. Азнабаев является редактором журнала «Проблемы офтальмологии», членом редакционных советов 5 медицинских научных журналов. Профессор М. Т. Азнабаев — Почетный член Президиума Общества офтальмологов России, возглавляет работу Ассоциации офтальмологов Республики Башкортостан.

Значительный вклад в развитие и работу кафедры внесли Сюняева С. И., Закиров Р. С., Семенова Е. Н., Еникеева З. Х.

Сюняева Сания Исхаковна — врач высшей категории, отличник здравоохранения СССР, кандидат медицинских наук, c 1974 г. по 2003 г. работала на кафедре, 1976−1992 г. г. являлась завучем кафедры.

Закиров Радис Саяпович — врач высшей категории, отличник здравоохранения СССР, кандидат медицинских наук, c 1975 г. по 2002 г. работал на кафедре (с 2000 г. — доцентом кафедры).

Семенова Елена Николаевна — врач высшей категории, отличник здравоохранения РФ, заслуженный изобретатель СССР, кандидат медицинских наук, c 1987 г. по 2010 г. работала на кафедре (с 1992 года — доцентом, заведующей учебной частью кафедры).

Еникеева Зухра Хамидовна — ассистент и старший лаборант кафедры с 1976 по 2010 гг.

С 1996 года в составе кафедры офтальмологии открыт курс офтальмологии ИПО с целью последипломного обучения врачей-офтальмологов, который в 2003 году был организован в отдельную кафедру — офтальмологии с курсом оториноларингологии ИПО, возглавляемую профессором Б. М. Азнабаевым. На кафедре работали заведующий курсом, доцент, к.м.н. А. А. Цыглин, доцент, к.м.н. Р. Ш. Абдурашитов, доцент, к.м.н. Э. А. Латыпова, к.м.н. Сюняева С. И., к.м.н. А. Ж. Жуманиязов, к.м.н. Т. Р. Мухамадеев, к.м.н. Самигуллина А. Ф.

Кафедра проводила последипломное обучение врачей на курсах специализации, тематического и общего усовершенствования, а также врачей-интернов и клинических ординаторов по офтальмологии и оториноларингологии. В октябре 2003 г. впервые в регионах России был создан тренажерный операционный зал «Wetlab» для обучения офтальмологов современным микрохирургическим технологиям и открыт на договорной основе практический курс «Wetlab по ультразвуковой хирургии катаракты». На кафедре обучались врачи-курсанты из Республики Башкортостан, других регионов РФ и стран ближнего и дальнего зарубежья.

В сентябре 2011 года произошло образование кафедры офтальмологии с курсом ИДПО БГМУ путем объединения 2 кафедр офтальмологии. Заведующим кафедрой был избран профессор, доктор медицинских наук, генеральный директор Научно-медицинской ассоциации «Оптимедсервис» Б. М. Азнабаев.

Консолидация опыта и потенциала профессорско-преподавательского состава позволила увеличить показатели образовательной, научно-исследовательской и лечебной работы, улучшить преемственность в подготовке научных и врачебных кадров от студенческой скамьи до профессионалов высокого уровня.